Количество команд участниц чемпионата СССР увеличилось со 113 до 164. Класс «А» пополнился 10 новыми коллективами. Причем, спортивным принцип комплектования элитного дивизиона никак назвать нельзя. Туда добавили команды союзных республик, не имевших представительства в высшей лиге (отдаленные со слабой футбольной инфраструктурой Киргизия, Туркмения и Таджикистан были проигнорированы). А также включили действительно сильнейший коллектив от РСФСР и команду Украины - «Авангард» (Харьков). Почему именно харьковчане попали в класс «А» остается загадкой. По результатам чемпионата 1959 года, повышения заслуживал «Локомотив» из Винницы или команда Одессы: суммарные показатели «Черноморца» и СКВО указывали на более высокий уровень футбола в нашем городе, чем в Харькове.
Украинские команды класса «Б» были разбиты на две зоны, причем, армейцы и моряки оказались в разных, и соревнование между земляками стало уже заочным.
Доукомплектовались армейцы Одессы Чертковым (николаевский «Авангард»), Масловским (львовский СКВО), Приймаком и Бондарем (ЦСК МО), Гурбичем (киевский СКВО). Покинули команду в межсезонье Гришин (запорожский «Металлург"), Норов (Николаев), Сулима (черновицкий «Авангард»), Назаров («Черноморец»), а также Шаров, Хомяков и Мирошниченко. После третьего тура соревнований был отчислен Першин («за недисциплинированность и аморальные проступки»).
Стартовые матчи показали, что армейцы Одессы настроены на самый высокий результат. Чего стоит хотя бы разгром учиненный ими 22 апреля в Горловке местному «Шахтеру»! Результат той игры до сих пор является самой крупной победой СКА (так вскоре после начала соревнований 1960 года стала именоваться армейская команда) в чемпионатах - 7:0 (отличились Лесик - 3 гола, Москаленко - 2, Блиндер и Щупаков). В матче с одним из своих главных конкурентов за первенство луганскими «Трудовыми резервами» одесситы довольствовались ничьей. В первых 14 турах СКА 4 раза сыграл вничью и 1О раз выиграл (причем, пять побед были одержаны подряд с разностью мячей 9-0!). Беспроигрышную серию армейцев прервал 18 июня запорожский «Металлург», потеснивший наших земляков на 2-е место в турнирной таблице. Правда, к концу первого круга одесситы вновь вернули себе лидерство во 2-й зоне, которое не уступали фактически до последнего тура соревнований.
Необъяснимый проигрыш 1:4 в Кадиевке (ныне Стаханов) закоренелому аутсайдеру во многом повлиял на итоговый результат. Впрочем, положение могла исправить победа в матче с запорожским «Металлургом» в Одессе. Но, открыв счет в решающей игре уже на 5-й минуте, СКА умудрился еще в первом тайме пропустить два мяча и проиграть. Вопрос о победителе зонального турнира был предрешен. Интересно, что матч с запорожцами в связи с огромным интересом проходил на Центральном стадионе ЧГМП. Следующую встречу в Одессе с «Локомотивом» (Сталино) армейцы также решили провести на этой же арене, которую игнорировали в прошлом году. Но тут, видимо, взыграли амбиции представителей «Черноморца», и было сделано все, чтобы СКА не чувствовал себя хозяином поля. На стадионе не было мальчиков, подающих мячи, в раздевалках судьи не обнаружили ни минеральной воды, ни чая. К тому же арбитрам на линии были выданы флажки, не отличавшиеся чистотой. Впрочем, негостеприимством армейцев нельзя было удивить. В Днепропетровске, Жданове, Херсоне, том же Сталино, их принимали и размещали на самом низком уровне.
В итоге одесский СКА, отстав всего на одно очко от запорожского «Металлурга», довольствовался вторым местом в зоне и сосредоточился на кубковых матчах, перенесенных с прошлого года. Армейцы вышли в полуфинал, где встретились с новоявленным чемпионом СССР «Торпедо» (Москва). Серьезного сопротивления наши земляки оказать не смогли -0:4. Так же неудачно для СКА закончились стыковые игры за 3-е место с винницким «Локомотивом» : 0:3 (в Одессе) и 2:3. В этих матчах два очередных гола забил Василий Москаленко, ставший лучшим бомбардиром нашей команды.
Неудачи на финише сезона привели к смене старшего тренера СКА (Одесса). Место Сергея Шапошникова занял Илья Лобжанидзе.
Как всегда, много было разговоров о необходимости объединить две одесские команды. Считалось, что тогда уж класса «А» - «не избежать». Дополнительным аргументом за слияние «Черноморца» и СКА стал международный товарищеский матч сборной Одессы с прославленным «Интернационале» (Милан). Объединенная команда разгромила итальянцев 5:1. Существенный вклад в сенсационную победу внесли армейцы, забившие 4 мяча: Щупаков-2, Блиндер, Подлесный.
В список 33 лучших футболистов Украины от СКА вошли: Каракозов (под № 2), Приймак (№1), Масловский (№3), Мизерный (№1), О.Щупаков (№1), Блиндер (№2).